计算机研究与发展

北大核心,JST,Pж(AJ),EI,CSCD

国内刊号:11-1777/TP

国际刊号:1000-1239

计算机研究与发展杂志2019年第7期:基于神经网络的药物实体与关系联合抽取

发布日期:

作者:曹明宇,杨志豪,罗凌,林鸿飞,王健,

关键词:联合抽取, 标注模式, 药物-药物交互, 关系抽取, 实体识别,

药物实体及关系抽取研究对于生物医学研究具有重要的促进作用,也是进一步构建生物医学知识库的基础.现存方法主要采用流水线方式,即先对文本进行实体识别后再对实体对进行关系分类.流水线方法主要存在任务错误传播、未能考虑2个子任务的相互影响和句子中不同关系的相互影响的问题.针对这些问题,提出了一种基于神经网络的药物实体与关系联合抽取方法.使用了一种新标注模式,将药物实体及关系的联合抽取转化为端对端的序列标注任务.使用词向量和字符向量作为词表示输入,使用BiLSTM-CRF模型进行药物实体与关系联合抽取.实验结果表明:在药物-药物交互作用(drug-druginteractions,DDI)2013语料集上,取得了89.9%的实体识别F-score及67.3%的关系抽取F-score,优于使用相同模型的流水线方法.

来源:2019年第7期

《计算机研究与发展》期刊编辑部

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